根据2015年11月（秋季）、2016年5月（春季）在舟山近岸海域进行的渔业资源拖网调查数据，运用相对重要性指数、平均拥挤度及种间相遇机率对采集的鱼类物种进行计测分析，重点关注主要鱼类（IRI>100）的幼鱼占比情况，并依据渔业资源密度对调查海域渔业资源量进行估算。结果表明：春季主要鱼类有11种，其中优势种为褐菖鲉（Sebastiscus marmoratus）、棘头梅童鱼（Collichthys lucidus）和六丝钝尾鰕虎鱼（Amblychaeturichthys hexanema）3种；秋季主要鱼类7种，优势种仅龙头鱼（Harpodon nehereus）1种，表明禁渔期结束后高强度的捕捞努力量短期内对渔业资源消耗较大。春秋季渔业资源量及幼鱼比例存在差异，秋季渔业资源量较高，而幼鱼比例较低，伏季休渔短期暂养的养护作用明显。平均拥挤度及种间相遇机率计测结果一致，均表明了群落优势度较高的物种的分布密集度和物种关联度也较高，种群集聚明显。研究认为，海洋渔业资源保护与海洋捕捞业可持发展中优先考虑保护幼鱼资源，以促进渔业增产，修复沿岸渔场。

根据2017年4月于嵊泗列岛邻近海域开展渔业资源底拖网调查的渔获数据，运用相对重要性指数、Shannon-Weaver指数、均匀度指数、丰富度指数、等级聚类和非度量多维度分析、生物量曲线等方法分析该海域鱼类种类组成、优势种、物种数量空间分布、生物多样性。该海域共鉴定出鱼类33种，其中优势种有棘头梅童鱼(Collichthys lucidus )、银鲳（Pampus argenteus）、龙头鱼（Harpodon nehereus）、凤鲚（Coilia mystus）等4种；与历史数据相比，该海域春季鱼类种类数锐减，优势种更替显著。根据适温性可分为暖温性和暖水性2类，分别为17和16种。各站位鱼类物种数在9~20种之间，整体呈嵊泗列岛北部海域高于南部海域的趋势。生物多样性分析表明，均匀度指数（J'）值较低，可能是舟山水域的污染导致多样性指数偏低。聚类分析结果表明，该海域鱼类群落结构空间差异较大。ABC曲线结果表明，舟山嵊泗列岛邻近海域鱼类群落结构处于严重干扰状态。综上所述，嵊泗列岛邻近海域鱼类资源受人类活动影响强烈，鱼类多样性指数偏低，群落结构空间差异较大。